3000万年前，黑暗使世界陷入恐惧。最终光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。光之巨人也用尽了全力，在红色的星球上陷入长眠。时光流转，在地球和平同盟TPU紧急组建精英小组“GUTS-SELECT”时，主人公真中剑悟正在刚刚开拓的火星上作为植…

研究民俗学的女孩堤春奈造访一位名叫叶山纯子的女子教师。后者曾经步入一个现实世界并不存在的电车站——如月车站，随后从人间消失长达七年之久。为了探明背后的真相，春奈希望纯子讲出自己的故事。在那个平凡的午间，纯子娓娓道来，思绪…

时间来到最终决战的两年后，在本应已迎来和平的地球上，怪兽们再度倾巢而出。与此同时，世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT（精英胜利队）也迎来了新的队长——时冈（中村优一 饰），众人开启了调查。一场关乎宇…